一、內部審計機構應重新公道定位
目前企業大部分的內部審計部分，基本上與其他職能部分平行，有些中小企業甚至還沒有獨立的內部審計部分，這樣就無法保證內部審計的獨立性和權威性。企業應在監事會下設審計部，審計部的設置需高於其他職能部分，審計部應對董事會負責，在業務上接受監事會的指導，這種雙重負責的組織形式有利於內部審計作用的充分發揮。
(一)內部審計的職能要從查錯防弊型向治理服務轉變。一般企業的內部審計職員往往將大部分精力投進到財務數據的真實性、正當性的查證及生產經營的監視上，其主要職能是查錯防弊而不是對企業治理做出分析、評價和做出治理建議，審計的對象主要是會計報表、賬本、憑證及其相關資料，工作都集中在財務領域而未深進到治理和經營領域。隨着企業內控制度的建立，外部約束機制的不斷加強，內部治理的逐步進步，會計電算化的普及，賬務表面的錯弊會越來越少，內部審計也應從傳統的防錯向服務轉變，內部審計的重點應從內部檢查和監視向內部分析和評價轉變。
(二)內部審計應從事後審計向事前審計和事中審計轉變。目前。一般企業的內部審計都是事後審計，主要起監視作用。隨着內部控制制度的建立，內部審計的作用將更多的體現在事前預防和事中控制。它將對企業內部控制進行全過程、全方位的監視和評價。內部審計應能及時發現各個環節存在的題目，把企業的風險降到最低程度。
(三)企業還應配備高素質的內部審計人才。隨着內部審計由財務領域向經營、治理領域的拓展，審計機構在職員的構成上也應是多元化的，不僅要有懂財務的審計人才。而且還應配備精通法律、治理等相關業務的專門人才，選擇有豐富業務經驗的職員加進內部審計部分，使內部審計在企業內部控制制度中發揮更大的作用，更好地進步內部審計的質量和效率。
二、強化內部審計工作，能有效防止內控失效
針對內控失效的現狀，在重新建立健全內控制度時，就應有針對性地加強相關方面的內部審計工作。
(一)根據各部分的特點，建立治理全程遞進式的監控措施。即在企業的生產經營一線，建立互相牽制、互相制約的內控制度，重要業務最好採用雙籤制，所以業務均要經過複覈，禁止一個人處理業務的全過程，建立以“防”爲主的監控防線。在會計部分常規性覈算的基礎上。內審部分對各個崗位、各項業務進行日常性和週期性的核查，建立以“堵”爲主的監控防線。通過內部稽覈、離任審計、落實舉報、紀律檢查、專項審計等手段，建立以“查”爲主的監控防線。通過以上三個層次的內控措施，不僅可以及時發現題目，而且對於防範和化解企業的.經營風險和會計風險。將起到重要的作用。
(二)加強內部考覈的力度，使內部審計工作制度化。爲了保證內部控制制度能有效地發揮作用。並使之不斷地得到完善，企業就必須對內部控制制度的執行情況進行檢查和考覈，由內審部分結合財務部分、企業治理部分等職能部分來具體執行內部檢查工作。檢查內部控制制度是否得到有效遵循。對執行情況做出客觀評價。並對於嚴格執行內部控制制度的，要給予精神鼓勵或物質獎勵。對於違規違章的，果斷給予行政處分和經濟處罰，並與職務升遷掛鉤。只有做到壓力和動力相結合，才能終極達到內部控制的目的。 (三)建立內部審計的獨立性和權威性，能對違法違規現象起到震撼作用。對內部審計中發現的題目，要分析出現違規現象的原因，如是屬於主觀原因的。要報請企業決策層，果斷予以查處，責令有關部分及時糾正：如屬於制度設計缺陷的，要會同有關部分，及時對制度內容進行完善，以保證內控制度的先進性和權威性。在內部審計中如發現違法、違紀案件，要決不姑息手軟，嚴厲追究相關職員的責任，並在企業內部給予通報。以起到警戒的作用。