1、構思不清
構思是對整篇文章的佈局、順序、層次、段落、內容、觀點、材料、怎樣開始和結尾的思維。構思時文章的主題中心要明確，用以表現的材料要充分、典型、新穎，結構上要嚴謹、環環相扣，只有潛心構思，才能思路流暢，寫好提綱和文章。
2、 以摘要代替前言
摘要動輒幾百個字，充斥着各種實驗方法和數據。有些作者特別喜歡羅列數字，讓人看得頭暈眼花。而到了正文的前言部分，反倒惜墨如金，幾十個字了事。這樣的前言作爲摘要的背景部分還差不多。多數期刊要求摘要限制在250個單詞以內，作者必須以最簡潔的語句闡明文章的背景、主要內容和意義。而前言則應回顧研究背景，提出問題或假說。很多中文作者對此沒有理解，只是簡單的說明研究目的，而對研究背景和問題不加理會。
3、思路或意思表述不充分
長期從事科研與論文寫作的一線醫學工作者的`經驗告訴我們，如思路或意思表述的不充分多半就是源自文獻閱讀量不夠。一篇文章存在刊發的可能性不是因爲出現了陽性的結果，而是能爲其他醫學工作者提供學術指引，能解決別的研究未曾解決的學術問題。從以上方面看來，沒有一定文獻閱讀量就不會了解研究的進展，也不能爲本研究提供一個學術定位。SCI期刊審稿人在審稿的過程中並不看論文的結果是陰性還是陽性，最重要是看究竟有無學術意義。
4、分組名稱隱晦難懂
實驗動物按照治療方法分了幾個組，作者命名爲A組，B組，C組，A+B組，B+C組和A+C組。讀者需要記住這些代號的含義才能理解各組不同的治療方法，讀到一半不小心忘記了，還要到前面再看一遍。其實直接用治療方法來命名簡單又明白。
5、試劑儀器單獨成段
很多作者喜歡把用到的試劑和儀器單獨寫成一段，這雖不能說錯，但並不通行。一般是在試劑和儀器出現的位置，以括號內容來介紹其廠商和產地信息。
6、濫用縮寫而不予介紹
有些作者似乎以多用縮寫爲榮，以此來顯示文章的高水平。而且使用了縮寫也不予以介紹其全稱，讓讀者去猜。其實應該儘量減少縮寫的使用。特別是不要自己創造新的縮寫，除非的確非常有必要。