1、內部審計力量薄弱
由於國有商業銀行機構衆多並且分散，爲了方便起見，只能允許相當一部分的工作人員直接接觸現金和證券等，並且擁有進入客戶賬戶的權限，這使得商業犯罪的機率大大的上升。爲了控制這種情況的發生，內部控制和審計任務非常繁重。但是商業銀行普遍存在着內部審計力量薄弱的情況，使得銀行內部出現審計監督不連續，審計面窄和間隔時間長等情況，不能及時發現和揭露商業銀行經營中的問題和風險隱患，弱化了審計監督的作用。由於銀行的業務流程更趨於自動化、系統更趨於複雜化、對信息技術的依賴性更強，國內商業銀行的內審也變得更爲複雜。
目前正協助工商銀行進行內審改革的一位安永全球金融服務部合夥人徐英偉說：“目前國內商業銀行在加快內審方面應取得董事會以及管理層的全力支持，並建立有效的公司治理架構和彙報路徑，採用以風險爲導向的審計方法，並充實和加強參與審計的人力資源，將招聘、培訓、考覈、輪崗等納入整體規劃。”
（1）內審人員數量不足。
據統計，目前我國銀行內部審計人員僅佔銀行員工總數的1％，而在國外銀行作佔的比例5％。按中國人民銀行總行的規定，要求銀行內部審計人員必須達到員工總數的2％，但是一般的分行內審部門配備僅10人左右，不僅如此，這些人員不僅要負責總行佈置的專項審計任務，而且還承擔所管轄的幾十家支行的審計任務。由於任務重，人手不足，審計監督的作用不能充分發揮。
（2）內審人員綜合素質差，業務能力較低。
內部審計是一項綜合性的工作，他要求內審人員必須具有良好的素質，對財務，審計，法律法規方面都有較爲深刻的瞭解。但是在實際的工作中，由於內審人員工作任務繁重，不能得到良好的培訓機會，往往會出現業務能力低下的情況。這不僅使得內審部門的工作效率下降，同時也使得內審的質量受到影響。
（3）沒有準入標準和考覈機制。
西方國家商業銀行對內審人員的要求普遍較高，如英、法兩國規定：所有內審人員都應具有大學學歷，具有註冊會計師或註冊內部審計師資格，一般在銀行財會或其他業務部門有過5年或以上的工作經驗。他們還對內審人員的素質和職業道德進行經常性的考覈，對達不到要求或違反職業道德的人員提出警告甚至取消其從業資格。目前，我國商業銀行並沒有在這個方面作出相關的規定，內審人員沒有準入的標準和考覈的機制。這使得內審人員放鬆對自身的要求，影響內審的效果和質量。
2、內審工作範圍過窄，內部審計技術落後
目前，商業銀行內部審計工作基本上還是賬目基礎審計，主要是採用了詳細審計或依賴於審計者個人經驗判斷的抽樣審計方法，這就使得內部審計帶有很大的隨意性，也缺乏科學性，而且也會造成審計時間長、成本高、審計的效率低下。而且這種內部審計工作僅侷限於查處一些具體違法違規問題，只注重檢查會計憑證、報表等資料是否真實、完整，業務操作是否合規合法等，缺乏對商業銀行特有的經營業務的審計，如信貸資產質量、風險責任、經濟效益的審計，以及對銀行內部管理結構、內部控制狀況、各崗位業務規範狀況等的審計。另一方面，國有商業銀行內部審計工作缺乏審計創新。面對商業銀行業務的不斷創新，經營範圍的不斷拓展，而我國國有商業銀行的內部審計變化緩慢，缺乏與之相應的審計程序。
在計算機審計運用上，隨着信息技術的發展和會計電算化的普及，審計內容、審計線索、審計證據的採集都發生了重大的變化，傳統的審計方式制約着內審作用的發揮。計算機審計越來越重要。而且商業銀行的經營特點和其在金融市場上的作用，也決定了計算機審計的重要性。但相比於國外的商業銀行還運用得很不夠。存在着不評價計算機系統、不測試數據的真實性、僅數據審數據等現象。這些陳舊的審計技術嚴重的制約着我國國有商業銀行審計的發展，影響到我國國有商業銀行內部審計的質量和效率。 六、對國有商業銀行內部審計存在問題的思考 針對上述分析總結出來的有關國有商業銀行內部審計所存在的問題，本人結合國內外內部審計的經驗及例子提出幾點解決我國國有商業銀行內審問題的策略。 （一）建立相對獨立的內部審計體系，完善內部審計機制