根據《中國學術期刊(光盤版)檢索與評價數據規範(試行)》和《中國高等學校社會科學學報編排規範(修訂版)》的要求，很多刊物對參考文獻和註釋作出區分，將註釋規定爲"對正文中某一內容作進一步解釋或補充說明的文字"，列於文末並與參考文獻分列或置於當頁腳地。
參考文獻按照其在正文中出現的先後以阿拉伯數字連續編碼，序號置於方括號內。一種文獻被反覆引用者，在正文中用同一序號標示。一般來說，引用一次的文獻的頁碼(或頁碼範圍)在文後參考文獻中列出。
格式爲著作的“出版年”或期刊的“年，卷(期)”等+“：頁碼(或頁碼範圍).”。多次引用的文獻，每處的頁碼或頁碼範圍(有的刊物也將能指示引用文獻位置的信息視爲頁碼)分別列於每處參考文獻的序號標註處，置於方括號後(僅列數字，不加“p”或“頁”等前後文字、字符;頁碼範圍中間的連線爲半字線)並作上標。
作爲正文出現的參考文獻序號後需加頁碼或頁碼範圍的，該頁碼或頁碼範圍也要作上標。作者和編輯需要仔細覈對順序編碼制下的參考文獻序號，做到序號與其所指示的文獻同文後參考文獻列表一致。另外，參考文獻頁碼或頁碼範圍也要準確無誤。
參考文獻類型及文獻類型以單字母方式標識：
專著M ; 報紙N ;期刊J ;專利文獻P;彙編G ;古籍O;技術標準S ;
學位論文D ;科技報告R;參考工具K ;檢索工具W;檔案B ;錄音帶A ;
圖表Q;唱片L;產品樣本X;錄相帶V;會議錄C;中譯文T;
樂譜I; 電影片Y;手稿H;微縮膠捲U ;幻燈片Z;微縮平片F;其他E。
參考文獻寫作舉例
1.期刊類
【格式】[序號]作者.篇名[J].刊名，出版年份，卷號(期號)：起止頁碼.
【舉例】
[1] 王海粟.淺議會計信息披露模式[J].財政研究，2004,21(1)：56-58.
[2] 夏魯惠.高等學校畢業論文教學情況調研報告[J].高等理科教育，2004(1):46-52.
[3] Heider, E.R.& er. The structure of color space in naming and memory of two languages [J]. Foreign Language Teaching and Research, 1999, (3): 62 – 67.
2.專著類
【格式】[序號]作者.書名[M].出版地：出版社，出版年份：起止頁碼.
【舉例】[4] 葛家澍，林志軍.現代西方財務會計理論[M].廈門：廈門大學出版社，2001：42.
[5] Gill, R. Mastering English Literature [M]. London: Macmillan, 1985: 42-45.
3.報紙類
【格式】[序號]作者.篇名[N].報紙名，出版日期(版次).
【舉例】
[6] 李大倫.經濟全球化的重要性[N]. 光明日報，1998-12-27(3).
[7] French, W. Between Silences: A Voice from China[N]. Atlantic Weekly, 1987-8-15(33).
4.論文集
【格式】[序號]作者.篇名[C].出版地：出版者，出版年份：起始頁碼.
【舉例】
[8] 伍蠡甫.西方文論選[C]. 上海：上海譯文出版社，1979：12-17.
[9] Spivak,G. “Can the Subaltern Speak?”[A]. In on & L. Grossberg(eds.). Victory in Limbo: Imigism [C]. Urbana: University of Illinois Press, 1988, pp.271-313.
[10] Almarza, G.G. Student foreign language teacher’s knowledge growth [A]. In man and ards (eds.). Teacher Learning in Language Teaching [C]. New York: Cambridge University Press. 1996. pp.50-78.
5.學位論文
【格式】[序號]作者.篇名[D].出版地：保存者，出版年份：起始頁碼.
【舉例】
[11] 張築生.微分半動力系統的不變集[D].北京：北京大學數學系數學研究所, 1983：1-7.
6.研究報告
【格式】[序號]作者.篇名[R].出版地：出版者，出版年份：起始頁碼.
【舉例】
[12] 馮西橋.核反應堆壓力管道與壓力容器的'LBB分析[R].北京：清華大學核能技術設計研究院, 1997：9-10.
7.條例
【格式】[序號]頒佈單位.條例名稱.發佈日期
【舉例】[15] 中華人民共和國科學技術委員會.科學技術期刊管理辦法[Z].1991—06—05
8.譯著
【格式】[序號]原著作者. 書名[M].譯者，譯.出版地：出版社，出版年份：起止頁碼.
注：爲了反映論文的科學依據和作者尊重他人研究成果的嚴肅態度以及向讀者提供有關信息的出處，應在論文致謝段後列出參考文獻表。 參考文獻表中列出的一般應限於作者直接閱讀過的、最主要的、發表在正式出版物上的文獻。私人通信和未公開發表的資料，一般不宜列入參考文獻，可緊跟在引用的內容之後註釋或標註在當頁作爲腳註或尾註。