如果你以爲論文寫作中，只有正文是重要的，參考文獻並不受你的重視，那麼你的論文寫作就進入了誤區狀態。你關心正文，讀者也關心正文，但你並不知道，讀者還關心你引用的是哪裏的文獻?引用的文獻有沒有權威性?
所以論文寫作，你還需要注意參考文獻的使用。
當你爲引言部分列參考文獻時，有一個小技巧——只引用最相關的文獻或一些論述詳盡的綜述。你可能沒想到這一點，但這樣做可以向編輯和審稿人展示你對研究領域有良好的知識儲備，並且瞭解重點是什麼。
舉一個簡單的例子，若你作如下陳述“C–Hactivation has become increasingly important in recent years [1]”，然後在參考文獻 1 給出 25 個不同的 C-H 活化的例子，這種做法並不是非常有用。如非必要，一些泛泛的陳述對促進所討論概念的理解是十分有限的，最好能避免。
優秀的文獻管理軟件會對參考文獻部分有很大幫助。一款優秀的文獻管理程序可以確保文獻序號的連續性，可以讓你針對不同的期刊應用不同的樣式，還可以自動更新參考文獻信息，避免造成混淆。有一些文獻管理軟件是以網絡應用程序形式存在的，很值得研究。
還有，請確保你的參考文獻部分是最新的。一份參考文獻如果沒有收錄很多最近發表的文章，等同於告訴編輯或審稿人兩件事：1.此研究領域已經不再流行;2.此作者對最新的文獻著作沒有很好的瞭解。如果你能這麼考慮問題，那麼你會意識到文章的參考文獻部分對審稿結果的影響比你想象的更大!
在一篇論文中，引用參考文獻論證自己的觀點或者理念是十分必要的。對於別人已經研究過的內容，我們便不需要重複的實驗研究，通過參考文獻的引用，便能簡要的體現我們想要表述的內容。但並非一篇論文的內容都由參考文獻堆積便可，正確的選用參考文獻至關重要。
一、避免選用脫離論文主題的參考文獻
選擇參考文獻必須緊緊圍繞主題，爲表現和論證主題服務。凡是能有力地說明、突出、烘托主題的就選用，否則就捨棄，這是選擇參考文獻的一個基本原則。有些論文在運用參考文獻時常常犯不忍割愛的毛病，將一些與主題無關的參考文獻，寫進文章裏，參考文獻與主題脫節，影響了主題的`表達。
甚至於有些論文只是爲了體現論文的參考文獻的新穎，直接使用了與論文主題無關的最新參考文獻，這不但沒能體現論文的參考文獻新穎，反而是內容累贅、多餘。
二、選擇參考文獻不夠典型
所謂典型參考文獻，是指那些最有特徵、最有代表性，能有力地揭示事物的本質，能集中地表現論文主題的參考文獻。圍繞主題選材，但沒有必要，事實上也不可能把與主題有關的參考文獻都寫進去，必須精選典型參考文獻。
對於十分經典的參考文獻，要考慮是否過舊，過舊的參考文獻或者廣爲人知的參考文獻，我們應該簡要概述。即便是十分典型的參考文獻，太舊或者已廣爲人知的參考文獻雖然能論證我們的主題但是卻讓文章的內容顯得不夠新穎。
三、選擇的參考文獻不夠真實
論文中用的參考文獻只有真實，纔有力量。所謂真實，是指參考文獻確是客觀存在的，能反映客觀事物的本來面貌。論文中所運用的參考文獻真實，論點才站得住，纔有說服力。而有些論文選材不準，沒有鑑別真僞，引用的歷史人物、事件、時間、地點、數字、引文等等沒有認真地核對，出現誤差。
這樣，文章不能叫人信服。這裏也有需要特別注意的一點，便是在引用參考文獻的時候，對於參考文獻的詳細內容，我們要細心做到每個細節都不能出錯，對於數字的摘寫要絕對的準確，不能因爲自己的疏忽導致原本準確無誤的真實參考文獻變成了錯誤參考文獻或者非真實參考文獻。
四、選擇參考文獻不新穎
撰寫論文，選擇參考文獻要新穎。新穎，就是新鮮，引人注目。寫文章選擇新穎的參考文獻，能增強論文的現實性，使入耳目一新。這就要求在寫論文時，要注意發現新生事物，選擇這方面的參考文獻。
要寫別人沒有寫過，或很少寫到的人和事。要從不同的角度選材，給人新鮮的感覺。要注意選擇新出現的有特色的參考文獻。有的論文，選擇不新穎，而是用一些過時的陳舊的事例，看上去是老面孔、老腔調，擺出的參考文獻是“陳年爛穀子”，沒有新鮮感和現實性，文章就顯得沒有說服力。
根據普賴斯指數的原理，相對而言，引用5年內的文獻越多，則普賴斯指數越高，過時的文獻越少，說明論文所涉及的問題越接近當前的前沿課題。實驗性文章的年代距離越遠，參考價值可能越低，因此一般要求所引用文獻的50%——70%應爲近5年內發表的文獻。
若老化的文獻所佔比例較大，則說明論文內容也較陳舊，如果論文所涉及的問題是目前國內外正在研究的熱門課題，則近5年內的文獻引用比例應較高，這可反映作者對同行的研究成果瞭解和掌握的程度。如果發現所引文獻確實過於老化，編輯有責任建議作者查閱較新近的文獻，因爲作者在接受新文獻後可能會改變原來的認識或結論。如果所研究的問題的確很有價值，且很難查找到近5年內的相關文獻，當然有必要引用5年前，甚至是幾十年前的文獻。
如果在整個研究期間不追蹤查閱有關文獻，就可能忽視近幾年來已被同行證實或解決的某些重大問題，而自己仍停留在課題研究時的認識水平，可見查閱近期文獻和儘可能着錄近期文獻的重要性。有些作者甚至以爲引用的文獻越老，越能說明自己的研究結果可靠，這是一種誤解。
如有一篇關於農村改革的文章，寫作時間是2015年，文中運用的數字事例都是2010年，顯然是調查不到家，用了一些過時的數字。但是，這並不意味着爲了新穎的參考文獻便能犧牲論文本身要論述的主題，即不可爲了新穎而使用與論文呢主題無關或者關係不大的參考文獻，這樣的論證只會本末倒置，得不償失。
五、參考文獻引用不當
參考文獻的着錄格式及標註均有較嚴格的規定，醫學期刊一般採用改良的溫哥華格式着錄參考文獻。近年來發現，一些具有較高學術價值的論文因參考文獻着錄格式的不規範或引用不當而延期發表或遭到退稿，分析其原因主要有如下幾點：
(1)着錄中的作者名缺少，稿約中明確規定，參考文獻中的前3位作者應全部列出，3位以上者只列前3位，後加“等”字或相應的外文。在不少來稿中發現只寫1位作者後加“等”的情況，因其他作者無從查證而耽擱了及時發表;
(2)着錄項目殘缺不全，有些論文缺少題名(書名)，亦有缺少刊名、年或卷、期及頁碼等;
(3)在正文中未標註參考文獻序號，無法證實參考文獻的實際用途;
(4)引用不當。未公開發表的觀察資料、內部交流資料及涉及保密的資料等均不宜作參考文獻。由於內部資料尚未得到公認且不夠成熟，其原理、論點、論據及論證尚需修改、變更或充實，又因其發行量很少，讀者面窄，無從查考，起不到參考作用。
六、參考文獻引用重複累贅
主要表現爲參考文獻引用不對應，標引參考文獻過多，規模龐大，而在文內不完全使用;或是文內使用很多，文後又不標明;或是不按出現順序排列而顛倒使用等。這都是論文完稿後未對參考文獻進行認真整理所致。一般而言，論着類論文的參考文獻數目要控制在15條以內，綜述類文章可略多，但不宜超過25條，且要有明確的引證目的。此外，同篇文章在參考文獻着錄時反覆使用現象亦應引起重視，尤其在綜述類文章中屢見不鮮。同篇文獻固然可以在文內引用多次，但無必要每引一次均重新着錄，即不管文內引用多少次，該篇引文在參考文獻欄內只能佔一個位置。