審計也如同盡大多數職業一樣，是一項需要依靠經驗和專業知識判定的活動，無論審計職員如何努力，審計風險盡不會控制到零的程度。審計風險存在於所有審計項目和整個審計過程中的每一個環節，任何一個環節出現失誤，都會導致最後的審計結論與預期出現偏差，形成審計風險，在一定時期內具有潛伏性。但是，只要審計職員保持職業謹慎，運用職業判定，對審計風險進行評估，制定並實施公道的審計程序和，還是可以將風險降低至可接受的水平。
一、事業單位內部審計風險的特點和表現
１．事業單位內部審計風險的特點。
（１）風險後果的間接性。由於事業單位的直接經濟活動有限，加之事業單位內部審計部分和職員一般不直接參與經濟活動，因此一般不會直接造成經濟損失；但內部審計部分提供的審計結論和審計建議，比如對領導幹部的任期評價，直接或間接到對被審人的任用，從而影響被審計人甚至其所領導的一個部分的；又如，審計建議影響到單位對某些方面或領域的重大決策，從而影響單位的改革、發展，審計風險帶來的後果是間接的。
（２）風險表現的隱蔽性。內部審計風險造成的各種損失特別是對事業單位生存、發展的宏觀方面，沒有直接的數據可用來衡量，故不被一般人所知曉，有的損失甚至內部審計機構和審計者本人都未覺察到。
（３）事業單位內部審計風險的產生原因是多方面的，但主要集中在內部審計機構和內部審計職員本身。事業單位內部審計風險的產生既有領導不重視，內部審計獨立性不強的原因，也有審計程序和審計方法的原因，但更多地表現爲內部審計自身的原因，如審計風險意識不強，審計職員知識結構不能勝任日益廣闊的審計領域等等。
（４）描述現狀，不進行評價，不表示意見也是事業單位內部審計風險的一個特徵。隨着事業單位各種環境的改變，事業單位碰到很多以前未曾出現過的事項。一方面，由於很多事項本來就在發展變化中還沒有相應的評價標準，暫時還看不清孰是孰非；另一方面，有的內部審計爲了避免審計風險，對所審計事項不敢定性，甚至不敢揭露，對所見的事項只就事論事，或羅列事項、數據，或描述現狀，不進行評價，就更不要說提供一些處理意見或爲領導提供建設性決策意見了。這樣的內部審計機構面臨的最大的風險就是自身的生存風險。
２．事業單位內部審計風險的具體表現。
（１）評價失誤，誤傷人，影響積極性。作爲事業單位，其經濟活動相對較少，內部審計更多的是對單位各部分執行國家政策和幹部任期經濟責任進行評價，假如評價不實，就會傷害人，影響相關職員的工作積極性。
（２）建議決策失誤，誤導政策的制定。內部審計的職能不僅侷限在查錯防弊，更多的是爲內部治理提供決策建議，內部審計部分接觸的各種信息，對各治理環節都比較熟悉；因此，內部審計部分更多地對單位的決策部分提供決策意見，假如提供的決策意見失誤，就會誤導政策的制定，造成隱性損失。
（３）錯弊不能有效查處，充當保護傘。假如通過審計，重大錯弊不能有效地發現，假如長期以往，就會被個別人所利用，從而客觀上成爲其達到個人目的的保護傘。
（４）審計質量低下，審計權威和自身進步。審計質量低下主要表現爲：審計報告失實、重大錯弊未能有效發現、提出的審計建議無法實施或實施後造成巨大損失等。審計質量低下有內部審計獨立性不強、審計職員自身素質的原因，也有審計和程序，但不管什麼原因，後果均會使廣大的職工特別是領導對審計機構和職員的熟悉降低，影響內部審計的威信和權威。同時，如內部審計職員不進步審計質量意識和審計風險意識，久而久之，也會影響其自身的進步。