研究層面
第一，選題不當
寫好英文論文要把握兩個「R」：relevance(相關性)和rigorousness(科學嚴謹性)。選題不當屬於相關性把握得不好。很多學生論文的選題缺乏創新性，最具代表性的是跟風寫作。什麼課題是熱點，就追做什麼課題，而不是知己知彼，科學選題。跟風選題的弊端很多：首先，容易和“牛人”做的課題重疊，這叫市場定位不清。如果把文章看作是公司的一個產品，那麼牛人的課題組就是大公司，團隊實力強，起點高，市場營銷能力也強。換句話説，就算你寫出了與牛人同等質量的好文章，和牛人的組比起來論文發表也是問題。其次，缺乏科學嚴謹性，很多學生選題不考慮問題的可驗證性，想的更多是有沒有創新性。例如，一個科研小組根本不可能拿到金融高頻交易數據，卻想做基於高頻數據的金融挖掘課題，最終只能無疾而終。最後，絕大多數科研是需要產出的，因而必須考慮研究的應用價值在何處。學生經常遇到的情況是，文章寫完了，甚至發表了，卻很快被塵封了，因為文章選題不具有應用價值。
那麼，應該如何選題?在我看來，選題就像是公司創業選擇方向，要練好眼力、定力和產生市場壁壘的能力。練眼力，既要培養廣度，也要培養深度。首先要學會泛讀相關領域的文章，能觸類旁通。找到研究空白後，要能精讀與研究缺口相關的文章，做到如數家珍。無論泛讀還是精讀，都需要有好的定力，這恰恰是很多學生所缺乏的。大多數學生喜歡急於求成。其次，選了一個好的題目，具備了先發優勢，還要考慮可能面臨的競爭。在競爭面前，提煉市場壁壘能力。
第二，對相關問題的研究現狀缺乏瞭解
寫文章首先要對問題的研究現狀有基本的瞭解，前面説的泛讀就可以幫助我們瞭解研究現狀。從事科研工作的人員越來越多，可發表論文的會議和期刊雜誌也越來越多，這就容易導致我們會漏讀一些相關的文章。找相關性文章的原則是：首先，要搞清楚所在行業的頂級、次級的會議和期刊。研究問題的現狀一定不能遺漏這些會議和期刊上的相關文章，這些文章的作者可能就是你要發表的文章的審稿人。我們發表文章的時候也應該發表在好的會議和期刊上，這樣文章受關注的程度也高。其次，要了解世界各地在該研究問題上比較有影響力的研究小組。要經常瀏覽他們的網站，實時追蹤他們的研究動態，做到知己知彼。他們同樣也是潛在的審稿人。
當了解相關的參考文獻後，文章引用要注意幾個問題：第一，有限度地自引用;第二，引用其他研究組的相關文章要做到儘可能平衡;第三，引用其他文章時，首先要肯定這些文章的閃光點，其次指出和自己所做工作的不同，儘可能不過於負面批評他人的文章。因為我們寫文章的目的是讓人欣賞我們的工作，所以指出不同就足夠了。
第三， 沒有貢獻或者貢獻不明確
通常文章被拒的主要原因是沒有貢獻、貢獻太小或者貢獻不明確。造成這個結果有兩種可能。第一種是文章確實沒有大貢獻。許多文章的貢獻只是現有技術的組合，或者對現有方法的微小改進。在這種情況下，學生往往還喜歡過度誇大文章的貢獻，結果適得其反。第二種是文章其實有很好的貢獻，但是作者沒能展示出來。在科研競爭日益激烈的環境下，我們要站在審稿人的角度去思考問題，審稿人通常每年面對非常巨大的審稿任務，很多情況下是審稿人的學生完成具體的審稿工作。這就意味着，如果作者沒有清晰地展示自己的技術和方法的獨特性，沒有提供充分、科學的驗證結果，那麼審稿人很難發現文章的貢獻，最終導致文章被否定。其實寫論文要求我們要講好一個故事，這個故事要生動，同時要邏輯清晰、背景清楚、細節明瞭，還要經得起推敲。
另外，在學術界有濫用數學公式的現象。有些作者在明知自己的文章沒有什麼貢獻的情況下，有目的地加入許多不必要的數學公式。目的是「如果我不能説服他們，那隻能迷惑他們(If I cannot convince people, just confuse them)」。雖然有很多文章最終靠濫用數學公式被錄用，但這樣的文章是不具有生命力的。
第四， 問題的挑戰性沒有充分展示
寫研究論文的一個關鍵點是要在文章中不停地強調問題的挑戰性，在摘要、介紹、方法、實驗和結論中都要展示。很多學生寫的文章只是簡單地描述問題、方法和實驗結論，沒有強調問題的挑戰性。整篇文章就像白開水，很難給讀者留下深刻的印象。通常描述問題的複雜性的最好方式是通過圖示或者舉例説明，比如通過一個例子介紹算法的工作，或者運用圖示顯示整個算法的流程。因為只有作者最瞭解問題的挑戰性，所以作者應該動腦筋以最簡單、最直接的方式把問題的挑戰性展示出來，並且在全文中不斷地用不同方式進行強調。
第五，研究方法缺乏驗證或驗證不足
科研文章離不開科學的驗證。總結起來，有4種驗證模式：第一種，最嚴格的驗證就是理論證明，比如嚴格的計算複雜度推導，或者上界/下界的理論確定。但是在很多情況下，特別是在計算機科學領域，有些研究方法沒辦法用純粹的理論證明，於是可以採用第二種混合辦法―有一些步驟可以被理論驗證，不能被理論驗證的部分可以用實驗驗證，比如數據包在網絡節點間的往返時間。在部分研究方法也無法用理論驗證的情況下，可以用第三種純粹實驗的辦法。該方法的嚴格程度不如前兩種，但至少可以證明問題的解決辦法在某些情況下的可行性。對於很多應用型計算機問題，純粹實驗驗證方法被廣泛使用，但也有其侷限性。科學嚴謹度最低的是第四種驗證方式――案例驗證。在某些情況下，大規模的實驗難以進行，只好提供幾個成功的案例。文章中提到的研究方法在提供的案例中是適用的，但結果不一定具有普適性。這四種驗證方式的嚴謹性逐步降低。在做計算機科研的時候，有時候不得不在科學嚴謹性和可行性之間取得平衡。
對上述驗證方式的選取一般奉行兩條原則。第一，無論如何都要驗證文章中的研究方法，要與現有方法進行比較。如果問題是全新的，現有方法中沒有合適的比較對象，就要學會左右手互搏，設計多種驗證方式，實現自我比較，選出最優方法。第二，儘可能選取科學嚴謹性高的驗證方式。
寫作層面
第六，組織混亂，缺乏邏輯性
一篇好文章通常可以讓大同行讀懂文章在研究什麼問題以及為什麼要進行研究。其實，好文章通常只描述一個故事(一個具有挑戰性的問題)，問題的引出、挑戰描述、解決方法、驗證方法和結論都是一氣呵成。邏輯性最難把握的是摘要和介紹。文章給人的第一印象最重要，而第一印象來自摘要，一個好的摘要通常寫得引入入勝、緊湊、邏輯性強。摘要的最高境界是無法改動一字。有了好的摘要，還需要在介紹中講出一個好故事，包括問題的背景、研究動機、具體問題、挑戰性、解決方案、驗證情況和最終結論。所以，能把文章寫得深入淺出並且引人入勝的人，一定可以成為邏輯性很強的市場營銷高手。
第七， 有無知的表現
有的學生寫的文章經常犯些低級錯誤。頂級會議或期刊是不可能容忍低級錯誤出現的。一篇有新意的文章在時間上也是等不起的，所以要避免低級錯誤出現。哪些是容易犯的'低級錯誤呢?(1) 以非常嚴格的方式定義一個小同行都知道的概念;(2) 對相關問題的研究現狀的瞭解有重大不足或錯誤，甚至故意忽視相關參考文獻;(3) 文章引用錯誤或者不恰當;(4)應用不正確或者過時的驗證法或驗證工具;(5) 使用錯誤的實驗數據;(6) 把常識當作新發現;(7) 文章寫得不規範，或者不符合投稿要求;(8) 從數學教科書中大量拷貝所謂的嚴格的數學證明;(9) 過度誇大文章的貢獻;(10) 試圖隱藏文章中研究方法的缺陷與不足;(11) 虛報實驗結果;(12) 在文章中對同一個實驗進行重複性地不同展示。
第八，英文寫作基礎差
中國學生寫英文文章共通的問題是英文寫作的基礎較差，其非常重要的一個原因是缺乏正規化的訓練。科研文章的美感在於簡潔、清晰、邏輯化。因為文章的目的是儘可能讓更多人在短時間內看懂，而不是炫耀華麗的辭藻，所以英文寫作要注意以下幾個原則：(1)儘可能用短句，避免使用複雜句;(2)當介紹方法、算法的時候，一定要用例子、圖例説明;(3)文章表達要生動，對圖、表、例子、數學證明的使用也要平衡;(4)文章的排版要有美感，不要把所有的文字，或者所有的圖、表堆積在一起，要均衡搭配。圖、表、例子要儘可能靠近描述它們的文字;(5)一定不要有錯別字和語法錯誤，如果不清楚就上網查詢;(6)要學會正確地使用縮寫單詞，在文章中第一次使用時一定要定義，而且在文章中的使用要一致，儘可能使用大家都約定俗成的縮寫，不要隨意發明創造;(7)要培養鑑賞美學的能力，首先要會欣賞美的文章，其次才談得上創造美的文章。
第九， 寫作不夠專業化
好的文章一定要展示作者的專業化。一篇專業文章的選題，首先要讓人耳目一新，至少給人的第一印象要好。其次要能清晰準確地指出文章的問題和方法的獨特性，並讓人瞭解問題和方法的難點、挑戰性在何處。第三，一篇好文章就像一個活生生的人，要有血有肉，各種該有的元素都要具備。第四，文章格式要專業化，要用最高的職業標準要求自己，比如一定用LaTeX寫文章，畫圖也一定用最專業化的畫圖軟件，要多看打印機打印出來的效果，注意細微之處。只有這樣，文章才能達到至少看上去很美。第五，平時多留意、多收集真的很美的文章，甚至可以不是自己研究方向的文章，把這些文章裝訂成冊，經常看，才能培養出對美的文章的感覺，才能學會欣賞。只有這樣，才真正有機會寫出很美的科研論文。