隨着農業產業化和農村城鎮化不斷推進，鄉鎮城鎮化擴張，工業集中區推進，鄉鎮面貌一新的背後是大量耕地被蠶食，耕地面積銳減;現行貨幣政策安置方式無法解決失地農民後顧之憂，失地農民生存難以爲繼;一些地方農村土地流轉不暢，要地農民呼聲與日俱增，引發深層次矛盾，諸多問題亟待關注和解決。總之，解決城鄉統籌過程中的農地問題是農村發展的基本問題，對探索農村土地合法有序流轉;保護耕地，解決失地農民的後顧之憂，切實維護廣大羣衆合法利益大有裨益。
一、存在問題
(一)土地糾紛頗多
“七種八養九行當，種糧是個虧行當。”這是前幾年農民種田難以掙錢甚至賠本的真實寫照。在糧價低迷，土地效益低下，稅費過高情形下，許多農民忍痛放棄土地。如今農村實行稅費改革後，農民負擔逐年減輕，國家惠農政策出臺使農民種田積極性空前高漲。而與此同時，以土地上利益糾紛引發諸多矛盾，主要有以下幾種：
1、管理上缺位。主要情形有
⑴昔日撂荒失地農民如今要地。市場經濟條件下，許多農民紛紛走南闖北，拋妻別子涌入都市“淘金”尋求致富路。舉家外出打工農民或他因無力耕種，農田被撂荒未流入他人。這樣撂荒農田被一些農民“拾田”耕種。如今種田划算。失地農民爲要地三番五次向鎮村反映，而佔地農民也不願意出田。同時，鄉村幹部認爲，以前土地效益低下時農民選擇打工不願意種田，苦口婆心勸說耕種也無濟於事，最終不得不找人耕種。現如今，眼見糧價上漲要地，哪有這樣便宜的事呢?
(2)昔日外出打工農民返鄉要地。外出務工農民將無力耕種的農田交給親朋友鄰代耕代種，也未辦理任何手續，這爲日後因土地的權、責、利而發生糾葛埋下“伏筆”。在種田效益低下，土地效益排徊不前情況下，農田多數是無償流轉，此前，農村土地流轉往往不規範。農民外出務工經商或因家庭缺乏勞動力致使農田棄耕，從而請人代耕，往往只是口頭約定的“口頭協議”、“君子協議”，未簽訂正式的土地流轉合同。農民在農田收益低的情形下，將農田交給種糧大戶及其它農戶代耕，耕種雙方權、責、利可分爲兩種情形：第一種情形是無償的，用農民自己的話來說是“兩不找”，轉讓方農民無須向代耕戶付費用，而代耕戶也不付任何報酬給轉讓方，而農業稅由代耕戶交納。另一種情形是轉讓方農民倒貼一點錢給代耕方。在糧價低迷情況下，農民種糧積極性不高，即使簽訂土地流轉合同也未經司法部門公證，合同往往失範。而如今，中央一號文件出臺後，國家對農業許多優惠政策，譬如減免農業稅費、降低農業稅率、發放糧補、早稻補貼等，極大地調動了農民種糧積極性，農民感受到現在種糧很划算，棄耕農民要求討要農田復耕，取得農田意願與日俱增，因而事後往往因土地流轉合同失範發生糾葛。
(3)農村人多地少戶口要地。前幾年，由於種田效益不明顯，甚至賠本。農民不願意多種田。這樣農村形成了“有田無人種”的窘境。現在形成鮮明對比的是，國家對農業反哺的政策出臺，糧價上漲，讓農民喜上眉梢，一些農民深感還是種田划算。農村土地承包改革後，土地承包政策是30年不變，村組人均耕地不均衡，加上前幾年農村計劃生育管理落後，超生人口在地改時未分到田。這樣一些家庭就形成人多地少。人多地少少戶要求調整農田和棄耕戶要求復耕，取得農田意願與日俱增，往往因土地利益與村委會及其它農戶發生糾葛。
2、管理上越位
《中華人民共和國土地管理法》規定“農民集體所有的土地由村集體經濟組織或村委會管理、經營，可由村集體組織的承包經營。”同時《農村土地承包法》第十條規定“國家保護承包方依法、自願、有償地進行土地承包經營權流轉。”在農業收益低下及農民對土地關愛程度偏聽偏低情況下，一些企業和農民利用自己的優勢，如資金、技術，租賃外出務工農民土地進行集中成片開發，發展規模經濟，而村委會往往越俎代皰，將外出務工農民棄耕承包田全部或部分收回調整重新對外發包，在農民不知情下越位代替農民談判、簽訂合同。農民要地，而企業和種田大戶則認爲，自己在稅改前簽訂合同，是“合法”的。在越位土地流轉過程中，農田大量向企業集中，爲追求利益最大化佔用農田進行種花植草，使基本農田保護面臨嚴峻考驗;同時加劇了要地農民與其之間矛盾。在農村，當農田向種糧大戶集中時，就產生鄉鎮政府和村委會越俎代皰代替農民簽訂合同，履行發包方權利和義務時，必須尊重農民個人意願。而在操作規程中，未經農民同意越位代簽合同，很難保證農民自身利益。
3、管理上錯位
市場經濟下，一些農民外出務工無力耕種，有的農民過去長期拖欠稅費。有的村委會以村民“你自己不盡納稅及挑圩籌資義務，還享受什麼權益呢?”爲由，強行收回農民手中的土地重新發包給其它農戶耕種，收取一定費用。另外，有的村爲追求利益最大化，低價收回外出務工農民土地，高價發包給一些企業或業主種植苗木、花卉，違背了現行國家政策。
(二)亂佔、圈佔，浪費土地問題始終未解決
人口，這是我國對世界作出的不朽貢獻。近年來，黨中央、國務院對土地問題嚴之又嚴，高瞻遠矚，相繼作出一系列重大決策。緊守這一條耕地保護“紅線”。是歷史和現實的客觀需求，也是踐行科學發展觀的根本要求。但近年來，我國各地小城鎮建設如火如荼之勢，許多鄉鎮城鎮化面貌日新月異，千百年來農民習慣於的“鄉土社會”正轉型爲“城鎮社會”，對於不少鄉鎮經濟與社會發展來說，發展小城鎮無疑是一個“大戰略”，同樣具體到每個小城鎮的建設也有個“戰略問題”。這就是在每個小城鎮建設過程中，如何保護好耕地問題。統籌城鄉經濟社會發展，加快小城鎮進程，爲全面建設小康社會提供物質技術基礎和生態環境雙重保障任務，就必須堅持在發展中保護耕地，把青山綠水留給子孫後代，把美好家園獻給人民羣衆。土地是最稀缺的不可再生資源。但只顧眼前，不顧將來的亂佔耕地在農村還依然普遍存在。個私企業異軍突起，無疑要佔用農地，同時勢必造成大量耕地閒置浪費;農村“空心村”存在，農民建房棄舊建新，造成村莊漸漸向外擴張，侵佔農田;更有些地方本着經營城市就是經營土地的觀念，發展經濟就打土地主意，依靠土地作交易，造成耕地銳減。