重慶交通大學開辦航海類、船舶類專業迄今已有60多年曆史，培養了1萬餘名各層次畢業生，遍及我國各大航運與船舶企事業單位。學校2006年12月成立航海學院，2015年5月正式更名爲航運與船舶工程學院。經過多年的發展，航運與船舶工程學院已成爲我國西部地區一流的高等航海和船舶教育基地。
學院目前開辦有船舶與海洋工程、輪機工程、航海技術和船舶電子電氣工程四個普通本科專業，其中輪機工程、航海技術每年各招收1個國家級卓越工程師班。學院擁有船舶與海洋工程專業學位碩士授權點，每年面向全國招收船舶與海洋工程專業學位碩士研究生。目前，學院各層次在校學生1500餘人。
學院現有教職工51人，其中教授副教授18人，碩士生導師15人，具有高級工程師、工程師、註冊驗船師、甲類船長、甲類輪機長等適任證書的雙師型教師22人。外聘專家、教授12人。
學院擁有“重慶市航海實驗教學示範中心”、“重慶市航海類專業人才培養模式創新實驗區”、“重慶市特種船舶數字化設計與製造工程技術研究中心”、“重慶市船舶工業產學研戰略聯盟”等4個省部級教學、科研與產學研合作平臺，3個校級研究所，1個校級重點建設學科。幾年來，利用中央與地方共建項目、交通運輸部共建項目等渠道累計投入實驗室建設經費2100餘萬元，建成了國際一流、國內領先的實驗室，爲學院可持續發展奠定了堅實基礎。
作爲西南地區唯一一所獲得國際認證的航海類、船舶類普通本科院校，學院在科學發展觀指導下，堅持以社會需求爲導向，弘揚“海潤有生，船行無限”的學院精神，秉持“立足西部、海河並舉”的辦學定位和“學以致用、求實創新” 的辦學理念，大力傳承航海文化、海洋文化。按照國際海事公約和國家海事法規要求，培養適應現代航運業與造船業發展需要的高級工程技術人才，爲我國航運和造船業的發展做出了突出的貢獻。