我們在科研工作甚至日常生活中遇到的縮略語比比皆是，可以輕易舉出很多例子，比如說到疾病，有 ALS、AIDS、PAH，致病的病毒 HIV、HPV，實驗的試劑 PBS、TBST、實驗方法 TUNEL、IP 等等。在科研論文寫作中使用縮略語時，需要注意下面幾點，一起來看看吧。
1. 一個詞或詞組在文中出現三次或以上纔可以用縮寫，否則需要寫出全稱
也就是說如果只出現一次或兩次，每次都要寫出全稱，而縮略語就不需要給出了。出現的次數是在摘要、正文 (從前言到討論)、每個圖注以及每個表注中分別計算的。如果一個詞在摘要中出現一次，正文中出現多次，圖注中又出現一次，那麼摘要中只要用全稱，不要用縮寫;正文中第一次出現時用全稱，後面用縮寫;圖注中用全稱，不用縮寫。
2. 縮略語在文中第一次出現時需要定義
這裏所謂第一次，也是摘要、正文 (從前言到討論)、每個圖注以及每個表注中分別計算的。如果摘要和正文都符合上面所說使用縮寫的規則，那麼摘要中需要定義一次，正文中還需要定義一次。定義就是寫出全稱並在括號中給出縮寫。
The patient was diagnosed with pulmonary arterial hypertension(PAH).
如果圖例或表格中爲了節省空間出現了縮寫，那麼在圖注或表注中要解釋縮寫。
PH: pulmonary hypertension, PAH: pulmonary arterialhypertension.
寫全稱時一般是全部用小寫，除非是人名、地名等專有名詞，而縮寫一般是全大寫，除非是約定俗成的寫法，比如用 ChIP 代表 chromatin immunoprecipitation。
雖然有時候我們可能覺得某個縮寫是論文所在領域非常普遍使用的`，沒有必要定義，可是還是應該考慮到也許有其他領域或者新進入這門領域的讀者會閱讀這篇論文，所以期刊都規定縮略語要先定義再使用。確實有不需要定義就可以使用的縮略語，比如 DNA，RNA，mRNA 在生物醫學領域的文章中就不需要定義，標準單位寫在數字之後(2 kg，5 mL)也不需要定義。
但是這種所謂的標準縮略語並不多，如果不能確定還是在第一次出現時給出全稱比較好，例如用 miR 代替 microRNA 還是需要定義的。有些期刊會列出該期刊中不需要定義就可以直接使用的縮略語，比如 Journal of Clinical Investigation 就給出標準縮略語列表 () 並指出這些縮略語可以直接使用。如果期刊沒有特別規定，應該每個縮略語使用時都要先定義。定義之後記得要一直使用縮略語，不要再使用全稱。
3. 儘量避免使用縮略語
一篇文章完全不使用縮略語不見得可行，但是儘量少用爲好，而且只使用比較常見的縮略語。使用縮略語的目的是爲了便於讀者對文章的閱讀理解，比較長的詞組如果反覆出現，不便於讀者的快速閱讀，所以用縮寫更合適。有些詞可能多數讀者對縮寫更熟悉，這些詞用縮寫也便於讀者理解。如果很多比較短的詞也用縮寫，而且不是普遍使用的縮寫，讀者就經常要停下來去查找縮寫代表的詞意，思路就會被打斷，所以會影響對文章的理解。
比如，有的作者把 mast cell 縮寫成 MC，這種用法並不常見而且意義不大，因爲 mast cell 只是兩個單音節的單詞，MC 雖然減少了一個單詞，但還是要念兩個字母，也是兩個音節，所以對於快速閱讀理解並沒有多大作用，反而很可能會因爲不知道這個縮寫代表什麼而減慢閱讀速度。還經常有作者將維生素的英文縮寫，把 vitamin C 縮寫成 Vc，vitaminD 縮寫成 Vd，這可能是因爲我們在中文裏說維 C，維 D 等等有關，而英語國家的人是不這麼說的，所以用這個縮寫會使英語國家的讀者感覺到難以理解，還是不用爲好。但是 vitamin D receptor 是經常被縮寫成 VDR 的。
4. 一個縮略語代表一個詞或詞組
在一篇文章中，一個縮略語只能代表一個詞(組)，而且一個詞(組)也只能用一個縮略語代表。如果已經用了 SNP 來代表 single nucleotide polymorphism，就不能同時用它來代表 sodium nitroprusside。雖然這兩個詞組確實都是通常縮寫成 SNP，但是在一篇文章中同時出現就會造成混淆，影響理解，所以只能其中一個詞組不用縮寫。
就這兩個詞組而言，用 SNP 來代表 single nucleotide polymorphism 更常見，而且這個全稱也更長一些，所以建議文中用 SNP 來代表 single nucleotide polymorphism，而 sodium nitroprusside 就用全稱。
5. 縮寫相關的複數和冠詞的用法
多數情況下，我們會用縮略語來代替一個名詞，所以如果是可數名詞也是有複數的。一般來說，縮略語代表的是名詞的單數形式，我們在後面加 s(或者加 es 如果縮略語的最後一個字母是 s)來表示複數。定義縮寫的時候通常就可以看出來，比如 endothelialcells (ECs)。
如果縮寫本身最後一個字母是 s，複數形式可能感覺讀起來不夠通順，比如 bispectral index 經常縮寫爲 BIS，但是用 BISes 來代表bispectral indexes 讀起來很不方便，所以通常會換一種寫法，可以用 BIS value 來表示單數，用 BIS values 來表示複數。
如果縮略語名詞前面需要加不定冠詞，要根據縮寫的讀音來決定是用 a 還是 an。例如 humanimmunodeficiency virus 縮寫成 HIV 時我們是念這三個字母，第一個字母 H 雖然是個輔音字母，念這個字母時卻是元音開頭，所以 HIV 這個詞的第一個音是元音，前面要用 an，例如 an HIV-positive test result。而 SARS 我們作爲一個單詞來念 [s?rz]，第一個音是輔音，所以前面要用 a，例如 a SARS epidemic。
掌握了上面這幾個原則，我們就可以通過恰當地使用縮略語來增加文章的可讀性。