一、體制中存在的問題
１．管理不健全。我國的水利工程事業在發展的過程當中，由於管理的疏忽，出現了很多的問題。這些問題嚴重影響着我們生產生活，如果不立刻解決，將會影響到國民經濟的穩步發展。首先，應加強對水利工程本身的建設管理，從近幾年頻發的洪水水災就可以看出，很多河道在平時疏於清理，造成了河道中泥沙的淤積，河水湖泊被開墾爲農田，加上洪水來臨之時人爲的設置了一些障礙，這就使水利設施的防洪能力降低，當洪水來時不能起到抵禦洪水的作用。其次，很多工程設備年久失修，又缺乏人爲對技術的更新改造，加上自然災害的威脅，我國農田的灌溉面積直轉急下，水利工程設施效益開始衰減。
２．行業隊伍缺乏社會保障。我國水管部門的工作地點大多位於偏僻的山間鄉野，由於生活條件差，工作環境艱苦，不少水利行業職工的平均收入水平低下，還有不到一半的水利管理單位不能維持單位職工的正常開支，基於這樣的情況，一部分職工開始自謀生路，尋求更好的發展。
３．缺乏對地位和發展的保證。首先，沒有重視水利在農業生活中的重要作用，缺乏對水利的資金投資建設。造成農村的水利建設相對落後，嚴重影響了農業經濟的發展。其次，我國現行的投資管理體制不適合水利經濟建設的發展，由於沒有充分認識到水的多方面特點，就不能對它進行有針對性的開發利用。再次，由於權力責任劃分的不清晰，很多由我國水利部門投資的建設被其他部門據爲己有，造成了經濟利益的轉移。不能做到投入和產出的平衡。也就不能提高水利職工的積極性，從而影響了水利管理的進程。最後，由於水利工程前期的準備工作做的不充分，施工質量較差，沒有形成完善的配套措施。而在發展後期，又沒有足夠的資金對其進行維護，這就造成了水利工程建設的弱勢局面。
二、對水利建設的建議
１．增加對水利的認識。隨着人口的增長及各項經濟事業的發展，人們對於水利建設的願望逐漸加強。首先，水利在農業經濟的發展中起到了核心的作用，農業的發展離不開水，沒有水利在農村種植方面的應用。就不會有我們今天十幾億中國人正常的生產生活。其次，由於水利不僅僅應用於農業建設方面，還在能源的開發利用上起到了很大的作用，水利在能源工業上的應用滲透到工業生產環節的各個方面。
２．對價格的調控。任何經濟建設都是有成本的，在市場經濟發展的今天，應加強對價格體系的調整，增加有償意識。在我國的很多地方，水利工程建設設施由於建設資金沒有落實或落實不到位，導致了很多水利基礎設施老化，無法正常投入使用。在以往舊的經濟體制下，水利經濟產生的效益被其他部門無償佔有，這樣不但影響了水利部門職工的積極性，還導致了經濟利益向外流出造成的產業利潤負增長，對水利建設實施積極的價格調控可以有效制止這類情況的發生。
３．開啓社會監管體系。由於我國現階段的經濟管理制度還處在不完善的環境下，很多企事業單位在對水利經濟進行監管的時候不自覺的放鬆了監管力度，這就讓一些水利部門在相對寬鬆的環境下鑽了空子，所以，國家應放寬監管力度，開啓面向全社會的監管體制，積極鼓勵廣大羣衆全面參與到水利監管組織中來。
４．改革投資方式。我國對於水利工程建設的投入一直有增無減，但是在社會化大生產的模式下，很難從根本上滿足多目標水利工程的建設，因此需要積極改革投資方式，有關部門應積極響應國家號召，集資籌建多目標的開發項目，按股份制對其進行統籌管理，使發展效益最大化。還可以吸引外資，借鑑外國的投資管理模式，形成集團化的生產方式。
５．加強配套設施的.生產建設。爲了促進水利經濟建設，我國對水利管理建設有很多的優惠政策和措施。首先，水電兩手抓，以水利促進電氣發展，以電氣反哺水利，構建水電電氣示範城市，以此鞏固小水電的經濟地位。其次，利用地區優勢，確保其能在防旱抗洪的前提下開發沿海地區的灘塗工業。並在水利資源和經濟資源都比較發達的地區集資籌建自來水事業，由籌辦企業運作並自負盈虧。還可以運用綜合手段對流域進行開發利用，如在現有水庫旁增設配電站。
６．建立專門的經濟實體。企事業單位通過與當地有條件的水管單位聯手，強化經營模式，完善經營承包制度，爲企業生存創造良好的外部條件，建立獨立的經濟覈算體系，對其進行網絡化管理，努力將它建設成一項完整的水利管理體系。
７．加強理論建設。構建現代化的水利經濟管理體制要以健全的理論作爲指導思想，對於改革中存在的問題，應組織水利機構相關工作者進行研究學習，根據在改革中遇到的實際問題，有針對性的進行分析講解，提高管理人員的專業管理素質。
三、結語
我們應深刻認識到在現代化社會發展的今天，水利建設在我們生活中有着舉足輕重的地位，通過以上對水利經濟問題的建設性分析，提醒我們水利事業的發展在我國還很緩慢，需要社會各界人士給予更多的關注，構建符合我國市場經濟體制的水利管理體系是需要多方共同努力的。