企業必須從系統全局出發，對設備壽命的整個週期進行研究，堅持動態觀點，注意事物內在的相互聯繫，並且分成一些小的部分去分析並解決相關問題，使設備使用的壽命週期費用最少，而提高了設備的綜合效能，盡力讓企業在經濟上獲得最大的效益，這也是製藥企業構建和實施製藥設備管理系統的終極目標。
1.設備管理所遇到的挑戰
1.1設備管理的定義不統一
設備管理的定義沒有明確統一是其存在的最大問題之一。如果要使建設的某個設備管理系統被普遍使用的話，就該明確其定義，包括這一領域中技術的應用，以及許多相關信息資源，當企業內部進行研討時要有統一的概念、見識等。
1.2如何滿足設備管理的複雜性
在通常情況下，設備的組織和管理的規模、範圍越大，它的複雜性也是在隨之加大的，潛藏其中的問題也更多且不容易發現和解決，給管理者的工作加大了難度。而且在針對這些複雜性做出應對工作時，還需尋求一些相應的符合要求的工具。
1.3設備的佔用率變化問題
研製的設施與設備的變化速度比較慢，標準少，系統組織較小，對外界的反應不夠。而在設備的設計者和它的管理者來看，社會和市場以及政策發生變化的速度和數量將繼續上漲，且大多數的變化是不可預料的，也就不能期望着能夠提前規定變化的發生。
1.4如何創造更超前的管理
在設備管理方面，時間是很有必要節省的，但是在特定的時間內設法提高工作效率則是重中之重。在制定從當前開始到未來發展的規劃時需要按照發展所需費用少的原則，同時也需要很多管理手段及工具。
此外，在設備管理過程中還會遇到的挑戰有：規模的增長、工作人員素質問題、設備組織結構、信息存在殘缺、政策的變化等等。雖然挑戰有如此之多，但我們用目前設備管理的一些工具和擁有的技術是可以解決的`，接下來提到的就是設備管理髮展相關對策，即如何讓製藥企業的設備管理髮展的更完善。
2.促進設備管理髮展的對策
2.1對設備的大、中修計劃要嚴格執行
設備的良好運行對製藥企業藥品的順利生產很重要，而設備的大、中修則要經過與其生產計劃部門商議，並切實要落實到位。在每年的年初時，設備管理部門就應該依照設備運行的狀況和記錄制定出大、中修計劃，要儘可能地合理完善，還要照此計劃預先將設備備件的購買和加工工作做好，以保證計劃能夠順利施行。如果在維修計劃正在實施時因生產任務或其它原因使得其不得不中止，則設備管理部門和生產計劃部門要共同協商另選維修時間。
2.2促進製藥設備技術改造一體化
當前階段，我國的製藥企業、尤其中藥製劑企業)技術裝備還處於較低水平，設備還沒有充分地實現機電一體化，對人高度的依賴體現在整個藥品生產過程中，品種和生產工藝相同，但不同的工人生產出來質量存在差異的藥品。其中生產工藝較落後是一方面，但設備機電不夠一體化是更主要的原因。爲了製藥企業的生產設備讓藥品生產更加順利，其設備管理部門就要有目的的對生產設備進行合理有效的技術層面的上的改造。比如可以在設備上應用現在較爲成熟的機電控制的技術，漸漸地接近機電一體化，逐漸減少生產時對人的依賴，從而保證在生產工藝相同條件下生產出質量穩定的藥品。
2.3提高維修人員素養
維修人員綜合素質的高低對設備有很大影響，比如關係到設備的使用壽命、維護保養週期和日常管理等。所以製藥企業要在員工培訓、考覈等工作上加大力度，確保他們可以勝任設備管理及維護保養工作。經過考覈後，可以讓管理人員、技術工人的工作態度科學嚴謹，同時也促進了自身業務水平的提高。
2.4運用新技術、使用新設備
如今科技發展迅猛，層出不窮的新技術和新設備讓企業得以更快地發展。關於此，製藥企業的設備主管部門――設備管理部門要努力蒐集新技術和新設備的信息，要儲備技術資料並加以運用，還可結合實際情況，提出一些建議幫助企業提高技術裝備水平、提高藥品質量、改善工藝。通過引進新技術、新設備，淘汰過時的舊設備可以解決許多技術問題，將大大提高生產效率，也改善了產品質量，讓企業在衆多競爭對手中更強。