(1) 準備工作：搜索和積累資料，包括文獻資料摘錄，實驗室的觀察數據，各種記錄，調查研究所得的各種結果等。所蒐集的資料越多、越豐富，觀察的問題就越全面，對分析、研究的問題 就越有利。
(2) 命題：①確定研究方向：由於學科種類繁多，內容廣泛，只有集中研究院某一學科領域中的某一方面的問題，才能選出合適的題目;②創新性：是醫學論文的宗旨。提出新的見解、新的觀點，作出新的.結論。總之要有自己的獨到高見;③要重視命題的必要性和可能性，防止盲目性;④標題是論文的題目：通常是研究的課題，起到畫龍點睛的作用;⑤標題必須名副其實：充分體現文章的內容，使題目和內容一致，鮮明醒目，簡短新穎，使人一目瞭然，易讀易記。
(3) 擬提綱：提綱是論文寫作的設計圖，是全文骨架，起到疏通思路，安排材料，形成結構的作用。①把初步醖釀形成的思路、觀點和想法用文字記錄下來，依據提綱行文，隨靈感、思路的深入會有新的想法、新的發現，使原來的設想得以修改、補充;②擬提綱一定要項目齊全，初步構出文章的大體輪廓;③醫學論文序論部分的主要內容是不什麼要研究這個題目，解釋研究和探討這一題目的現實意義。
(4) 初稿：①在基本觀點已經明確，參考或引用文獻資料業已準備妥當時，可按提綱的順序分段進行;②初稿一定要定得紮實、圓滿，令自己感到十分滿意。
(5) 初稿修改及定稿：起草初稿很重要，但修改初稿同樣也重要。①修改是對初稿的內容不斷加深認識，對錶達形式不斷選擇的過程;②修改的原則是發現什麼問題修改什麼問題;③修改時常需要作者把初稿反覆閲讀幾遍，每讀一遍就有一次新的感受，就能發現一些不足，然後進行修改加工;④修改時着重考慮內容、格式、序號、外文字母、表格、插圖及參考文獻的序號是否符合要求，以及有無錯別字。