日本修改了運行35年的《健康保險法》,制定了全民必須參加《醫療保險法》，要求公平地向全體國民提供醫療服務，目前日本國民醫療保險覆蓋率爲99％，爲世界之最。
醫療保險可分爲２大類，一類被用者保險或稱之職工健康保險，其中可分爲共濟組合保險，組合掌管保險、政府掌管保險，船員保險等佔65.9％，另一類是國民健康保險，主要是農業人口，退休老人，自由職業者，其可分爲市町村國保、組合國保２種，佔34.1％。
醫療保險經費來源，個人按收入８％交納，不足部分由國家及地方財政補貼，凡參加醫療保險均可報銷一定比例的醫療費用，大部分爲80%至90%,自付10%至20%,家屬可報銷70%至80%,凡醫療費6.7萬元/月以上,超額部分實行全額報銷。
對承擔醫療保險的'機構即醫院、診所和藥房都要簽定承擔醫療保險任務的合同，合同由地方政府及保險組合聯合審批。醫療保險一般不實行定點醫療，病人有自由選擇醫院和醫師的權利。醫療保險支付標準，由厚生省中央社會保險醫療協會第２年修訂１次，患者就醫時，除了自付掛號費和自付部分外，其餘醫療費用由醫院每月向醫療保險組織提供結算清單和票據，報酬計算論據《醫療保險點數表》進行積分計算，每點分值爲10日元。如住院進行消化道潰瘍診療，住院費、診療費、檢查費累計爲１萬點。合計費用爲１０萬日元。但保險組織對醫療費用的支付相當嚴格，需由醫療保險支付基金和醫療顧問聯合審覈後方支付。
要加入國民健康保險必須到附近的市政局繳納保險費和辦理手續。加入國民健康保險後的醫療費個人只須承擔30％。當受傷或患病需接受治療時，請出示保險證，但保險試用範圍之外的醫療費的全額，則須要由自己負擔。