中國古代哲學思想能夠解釋傳統的中醫學，也應能解釋現代的西醫學，那麼對中國古代哲學思想與中醫學的關聯性探究又是如何的?
中國古代哲學思想和中醫學堪稱中國傳統文化百花園中的兩朵奇葩。作爲中華民族在與疾病長期的鬥爭和實踐中發展起來的中醫學，起源於《黃帝內經》，在其發展過程中不斷地吸收中國古代哲學思想，使之深深打上了哲學的烙印。本文擬從以下兩個方面來探究一下中國古代哲學思想和中醫學的契合點。
一、陰陽五行學說是中醫學的哲學基礎
任何事物都可以用陰陽來劃分，凡是運動着的、向外的、上升的、溫熱的、明亮的都屬於陽;凡是相對靜止的、內守的、下降的、寒冷的、晦暗的都屬於陰。我們把對於人體具有推進、溫熙、興奮等作用的物質和功能統歸於陽，對於人體具有凝聚、滋潤、抑制等作用的物質和功能歸於陰，陰陽是相互關聯的一種事物或一個事物的兩個方面。陰陽五行學說是中國古代漢族人民創造的樸素的辯證法的哲學思想。
在中國古代樸素辯證法中，老子的哲學思想對中醫的影響居於首要地位：老子認識到自然、社會、人事等都是對立統一的。《道德經》中出現的成雙成對的矛盾概念就達七十句之多。在第二章的“有無相生，難易相成，長短相較，高下相傾，聲音相和，前後相隨”揭示了正反兩級相互對立、相互依存的關係，失去一方，則對方不復存在。這種矛盾觀滲透到醫學領域，得到了廣泛的應用，豐富了中醫理論的`內容。《黃帝內經》中的“陰平陽祕，精神乃治”“陰陽離決，精氣乃絕”就體現了矛盾雙方相互依存的關係。
一方面，中醫學吸取和借用了道家文化的精華，借用陰陽學說奠定了人體陰陽動態平衡的整體治病理念，把人體中所有對立面的動態的生命現象概況爲陰與陽一對矛盾，當陰與陽處於平衡時，人體是健康的，陽佔上風或陰占上風時人體內陰陽相對處於不平衡狀態時就會出現疾病，通過服藥、鍼灸、點穴等方法幫助人體陰陽重新達到平衡，從而恢復健康;另一方面，中醫借用八卦學說創立了“五行”(金、木、水、火、土)對應相關臟腑生理病理的變化規律學說，用以指導觀察和確定有關臟腑病症的治療原則。
二、辯證的整體觀是中醫學的指導思想
整體觀是指從全局考慮問題的觀念。整體觀首先是指自然界本身是一個整體，人和其他生命、物種都是其中的一部分，如果這個整體或某一部分受到損害，那麼其他方面也將受到影響，整體則因之破壞。整體觀又是指將生物機體與自然環境、五臟六腑、五官這些不同層次的系統、組織看成統一的整體，就是指觀察事物、解決問題能着眼於全局的一種心理能力。
我國古代哲學特別講究的是天人合一，是以整體觀來把握整個對象的。儒家認爲，天和人都是同一個宇宙，沒有你我之分，只有大小之分。由於天是圓的，地是方的，因此人的頭是圓的，而腳自然是方的。天上有日月星辰和風雨雷電，因而人有七情六慾和五官。地上有九州，因而人有九竅。圓周分爲三百六十度，人因而有三百六十根骨骼。中國有十二條河川，因而人有十二條經脈;五行說認爲世界是由金、木、水、火、土這五種元素構成的，那人體同樣也是由五行所構成。當五行在人體內分佈均勻時(生克有序時)，人體便是健康的，但如果五行在人體內分佈不均(生克出現混亂)，人體就會出現疾病了。另外，五行不僅跟五臟六腑相對應，同時它還跟五色、五味、五音、五方等息息相關。
所以老子哲學中的整體觀在行醫中體現爲不是頭疼醫頭、腳痛醫腳，而是從人的整體上去尋找病竈和病因，採取辨證施治、五臟六腑同時調整的方法，治非所痛而病卻好了。現代西醫學企圖由局部認知整體，這種方法本身就不夠科學嚴謹，是有一定缺陷的，只有將整體中的局部都認知清楚了，再將其有機聯繫起來，纔可認知整體。
此外，古人也特別強調人類一定要遵循自然規律。《黃帝內經》中指出：“智能者之養生也，必順四時而適寒暑，和喜怒而安居處，節陰陽而調剛柔。”就是強調人與自然和諧的天性，強調我們要想保持健康，一定要遵循大自然的規律去工作和生活：大自然的四季之分，在中醫中就有“春生”“夏長”“秋收”“冬藏”的說法。例如，到了冬天，萬物都收藏起來，此時身體中的陽氣處於藏的狀態，儘量少出汗，也不能做耗散陽氣之事(冷天吃冰激凌、西瓜、冬泳都是耗散陽氣的)，部分女同胞冬天穿露膝褲，也是耗散陽氣的，很容易得寒溼一類的疾病。又如，中醫還將一天分爲十二個時辰，根據日出日落的自然現象，認爲人體內的臟腑活動規律也是與天地一致的，例如，夜裏十一時至凌晨一時，是膽經活動的子時，陽氣開始生髮，此時睡眠好了，膽氣就好，人的“膽氣”和“膽量”就足，因爲膽在中醫中還有主決斷的作用。但現代人此時正是夜生活的開始，這種違法自然規律的行爲必然要受到懲罰。
綜上所述，不難看出中國古代哲學思想是一種偉大的思想、一種偉大的哲學、一種源自對世界深刻的觀察和思考的哲學思想，它不僅能夠解釋傳統的中醫學，也應能解釋現代的西醫學。相信在未來的歲月中會有越來越多的人能夠領會到中醫治療和保健的真諦，相信中國古代哲學思想將推動中國中醫學理論不斷走向完善，相信中國的中醫學將在這種思想的指引下放出更加耀眼的光芒。