中國醫科大學研究生教育始於五十年代。爲全國首批經國務院學位委員會批准具有碩士和博士學位授權的高等學校之一。1978年恢復研究生教育和1981年實行學位制度以來，在教育學、理學、工學、醫學與管理學五大門類中總計授予碩士和博士學位4507人。面向全國招生，並招收外國留學生和港、澳、臺地區研究生。今年研究生招生規模計劃爲800餘人，研究生課程進修班300餘人。年度招生本研比1.65：1，碩博比1.95：1。目前在校研究生總計2010 人，研究生導師746人，其中博士生導師187人。博士學位授權一級學科2個，博士學位授權學科、專業點43個，碩士學位授權學科、專業點55個。研究生在校參加國內外學術會議交流與發表學術論文年人均4.67篇。1998年我校經國務院學位委員會批准爲全國首批開展臨牀醫學博士專業學位(MD.)和臨牀醫學碩士專業學位(MM.)教育試點單位;隨後又相繼開展了口腔臨牀醫學碩士專業學位(SMM.)和公共衛生碩士專業學位(MPH.)教育試點工作。 1986年以來，開展授予具有研究生畢業同等學力人員申請碩士、博士學位工作。經過二十餘年的不斷建設與發展，建立了一整套規章制度，並形成了一支年齡與知識能力結構合理的專職管理幹部隊伍。我校學位與研究生教育，已經形成多學科、多層次、多渠道的研究生教育體系和理、工、醫、管相結合的多門類、多類型、多級別的學位授予制度。
在校黨委的正確領導下，在上級主管部門的指導下，中國醫科大學的學位與研究生教育的規模、培養層次、培養類型都得到迅速發展，研究生培養質量與學位授予質量也得到有效地保證與提高。同時，在不斷加強研究生院管理機構建設過程中，也進一步完善了研究生培養質量保證體系。歷經25年的學位與研究生教育實踐，已經建立起黨政齊抓統管的校、院系、教研室"三級責任管理體制"和"三管、兩定、一包"的有效運行機制;初步構建了以本校爲主，以外國大學、科研機構爲延伸、以國內院校、醫療機構爲補充的跨學科、跨院校、跨地區與跨國家的開放式研究生培養體系;深化醫學專業學位教育改革，開發利用社?quot;臨牀資源"，拓展培養新途徑，建立醫學專業學位研究生"培養基地"或"工作站";創立了研究生培養目標與過程管理的"縱向跟蹤環節管理"新模式;建立了研究生教育經費的多元化資金籌措渠道;自行設計開發了學位與研究生教育信息計算機管理系統和查詢系統;爲完善研究生培養質量保證體系，建立了《研究生導師工作責任制》和《研究生學術道德規範管理條例》，以及社會用人單位對研究生培養質量評價信息反饋系統;啓動研究生培?quot;雙創工程"，即研究生創新能力培養與爭創全國優秀博士論文;建立激勵機制，堅持開展優秀研究生培養集體、優秀研究生導師的"雙優"評選活動和研究生在校獲得科研成果實施獎勵措施;爲堅持把德育教育滲透於研究生培養全過程，建立了研究生日常行爲三級考覈的德育輔助系統;以研究生黨支部、研究生班、研究生會三個實體爲依託，依靠黨團員、學生幹部和非黨積極分子三支骨幹隊伍，通過開展助教、助研、助管"三助"活動，形成研究生參與管理、研究生互相管理、研究生自我管理的"三三制式"研究生羣體內部自主管理的新格局。
總之，通過大量的管理工作實踐，既鍛煉出一支年齡、知識與能力結構合理的管理幹部隊伍，同時也推進了學位與研究生教育總規模達到我校歷史的最高點，並取得了顯著的社會效益與經濟效益。畢業的碩士、博士學位研究生，已經成爲用人單位教學、科研、醫療工作的骨幹，學科與學術帶頭人。其中爲數不少的畢業生還擔任醫學院校、三甲醫院主管領導和省市級衛生行政機構或政府機構省、廳、局、處級領導職務，爲我國高等醫學教育和醫療衛生事業的發展做出了重要貢獻。
中國科大學研究生院1995年榮獲衛生部部屬院校學位與研究生教育工作"教書育人、管理育人、服務育人"先進集體;1997年被評爲遼寧省"研究生教學管理優秀單位";1999年被評爲遼寧省"學位與研究生教育研究先進科研單位";同年被國家教育部、國務院學位委員會授予"學位與研究生教育管理工作先進集體"榮譽稱號;2001年被評爲遼寧省"研究生教育管理工作優秀單位";2002年被評爲遼寧省"畢業研究生就業先進集體"。