工程學院下設四個系：海洋工程系、土木工程系、機電工程系和自動化及測控系，七個本科專業：港口航道與海岸工程、船舶與海洋工程、土木工程、工程管理、機械設計製造及其自動化、工業設計、自動化。設有水利工程博士後流動站，港口海岸及近海工程博士點，水利工程、機械工程、控制科學與工程、土木工程一級學科碩士點，並在水利工程、項目管理方向招收培養工程碩士研究生。同時擁有港口、海岸及近海工程國家重點學科(培育)、海洋工程環境、結構與防護山東省重點實驗室及“港口航道與海岸工程”全國特色專業。學院現有教職工130人，其中，博士生導師17人、教授31人、教授級高工1人、副教授35人、高級工程師4人。有國家有突出貢獻中青年專家2名，教育部長江學者特聘教授1名，國家傑出青年基金獲得者1名，山東省教學名師1名，教育部新世紀人才計劃8人，山東省突出貢獻專家1名，山東省技術拔尖人才2名。目前在讀博士、碩士研究生400餘名，本科生1600餘名。
港口航道與海岸工程Harbor,ChannelandCoastalEngineering
本專業培養掌握港口、航道與海岸工程領域以及相關工程領域(水利工程、海洋工程和土木工程等)基本知識與技能，能在水利、能源、交通等部門從事港口與航道工程、海岸與近海工程、工程環境的規劃、勘察、設計、施工、管理等方面工作的高級工程技術人才。本專業2011年入選了教育部第二批“卓越工程師培養計劃”。
主要課程有：工程力學、水力學、土力學、工程水文學、鋼筋混凝土結構、河流動力學、海岸動力學、港口規劃與佈置、港口水工建築物、航道工程學、海岸工程學、概預算、港口管理等。
畢業生主要去向：與該專業相關的工程設計、施工、管理、科研等單位及海軍部門。
電話:
聯繫人:劉勇副教授/教研室主任
船舶與海洋工程NavalArchitectureandOceanEngineering
本專業培養掌握船舶與海洋工程基本理論和專業知識，具備工程規劃、設計、建造、施工和管理方面的能力，能夠在船舶與海洋工程領域從事相關工作的富有創新精神和實踐能力的高級專門人才。
主要課程有：材料力學;結構力學;流體力學;海洋工程環境;海洋工程波浪力學;結構有限元分析;海洋平臺結構;船體強度與結構設計;船舶原理;海洋工程結構檢測;海洋工程建造與施工;深水工程等。
畢業生主要去向:海洋工程設計院、海洋石油公司、海洋工程研究院所、船廠、船級社、海軍有關部門(國防生)、相關的政府機構、報考研究生並進一步出國留學深造。
說明：中國海洋大學(中國)與斯特萊斯克萊德大學(英國)簽訂了合作協議，本專業的學生可以申請到斯特萊斯克萊德大學造船及海洋工程專業進行學習，成績合格後獲得對方大學的學士或碩士學位。
電話:
聯繫人:劉福順副教授/教研室主任
土木工程CivilEngineering
本專業培養掌握土木工程學科的基礎理論和專業知識，具備從事土木工程的項目規劃、設計、研究、開發、施工及管理的能力，獲得工程師基本訓練，能在房屋建築、岩土工程、道路及橋樑工程、低碳與節能工程等土木工程領域的設計、施工、管理、教育、研究、投資和開發部門從事技術或管理工作的高級專門人才。本專業注重基礎理論和工程技術的教學，注重綜合素質和創新精神的培養，注重提高學生理論與實踐相結合的能力，使其具備土木工程設計、施工和管理過程解決實際問題的能力。
主要課程有:理論力學、材料力學、結構力學、土力學、房屋建築學、土工工程材料、工程測量、混凝土結構基本原理、鋼結構設計原理、基礎工程與地基處理、房屋結構設計、建築結構抗震設計、高層建築結構、土木工程施工、橋樑工程、路基路面工程等。
畢業生主要去向:畢業生可在設計院所、施工企業、高等學校、科研院所、政府職能部門、各類開發公司等從事土木工程的勘測設計、施工技術和經營管理、教學科研、基本建設管理、工程諮詢、工程質量監督和監理等方面的工作。具有一定工作經驗後還可考取國家註冊結構工程師、註冊巖體工程師、註冊建造師、註冊監理工程師及註冊造價工程師等。本專業爲國內較熱門的專業，就業前景良好，畢業生全部就業。繼續深造可報考
結構工程、道路與橋樑工程、岩土工程、工程管理等專業方向的研究生。每年被全國各重點高校土木工程專業錄取爲研究生的學生接近當年畢業本科生總數的30%左右。
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聯繫人：杜德潤教研室主任
工程管理EngineeringManagement
本專業培養具備土木工程技術的基礎知識，掌握現代管理科學的理論、方法和手段，熟悉工程項目建設法規,瞭解工程建設慣例，有較強的實踐能力，能在國內外工程建設領域從事建設工程投資諮詢、建設工程項目策劃、施工管理、建設監理、工程造價、房地產開發與經營管理等工作的高素質複合型管理人才。目前該專業擁有工程管理學士學位授予權，管理科學與工程、項目管理碩士學位授予權。
主要課程有：管理學原理;經濟學原理;房屋建築學;工程力學;工程結構;經濟法與建設法規;工程經濟學;工程項目管理;土木工程施工;工程估價;工程招投標與合同管理;房地產開發經營與管理等。
畢業生主要去向:可在與該專業相關的政府機構、房地產公司、施工單位、建設監理單位、工程造價諮詢部門及設計、科研院所，從事工程項目管理、工程估價、項目投資分析、工程項目招投標和國際工程項目管理等工作。本專業覆蓋面寬，從業範圍廣，社會需求量大。
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聯繫人:孫燕教研室主任
機械設計製造及其自動化MechanicalDesignManufactureandAutomation
機械設計製造及其自動化專業以培養國家制造業及海洋資源開發所需要的具有國際競爭能力的創新人才爲目標，以強大的工程學科爲基礎，以雄厚的科研實力爲支撐，使培養的學生具有科學的知識結構、強大的實踐能力、開闊的國際視野、強烈的創新意識與合作精神、自信的溝通能力。具體包括:掌握機械設計、機械製造的基礎理論和方法，熟悉電子技術、自動化技術及計算機技術,能在本領域內從事機械產品的設計製造、科技開發、應用研究和經營管理等工作。