浙江工業大學坐落於風景秀麗的杭州市，是一所以工爲主，文、理、法、經濟、醫藥、管理、藝術、教育等兼容的省屬重點大學，2009年6月8日，浙江省人民政府和教育部簽訂共建協議，浙江工業大學進入省部共建高校行列。
在中國工程院院士沈寅初教授的倡議下，浙江工業大學藥學院於2000年開始組建，2001年11月28日正式掛牌成立。在十年的發展歷程中，學院不斷創新辦學理念，整合資源，匯聚人才，在學科建設、人才培養、科學研究、社會服務等諸方面實現了令人矚目的跨越式發展。
學院學科門類齊全，培養層次完善。設有藥物化學博士點和藥學一級學科碩士點，擁有藥物化學、藥劑學、藥理學、生藥學、藥物分析和微生物與生化藥學六個碩士學位授予權，擁有製藥工程、藥學專業學位授予權。擁有製藥工程（含化學制藥和生物製藥兩個方向）、藥物製劑、藥學、中藥學四個本科專業，其中製藥工程專業獲得國家第四批高等學校特色專業建設點。現有博士研究生、碩士研究生562人，本科生1045人。近五年，本科畢業生一次簽約率年平均93.36%，升學率保持在25%以上，居全校前列。
學院擁有一支學術造詣精湛、教學經驗豐富、敬崗愛業、年輕高職化的師資隊伍。現有教職工89人，其中正高級職稱25人，副高級職稱36人，高級職稱教師佔全院教職工總數的68.5%；具有博士學位教師45人，博士生導師10人，碩士生導師34人。擁有浙江省重點創新團隊1個，教師中有享受政府特殊津貼、浙江省特級專家、浙江省有突出貢獻中青年專家1人，浙江省高校中青年學科帶頭人4人，浙江省“新世紀151人才工程”23人。
學院擁有綠色化學制藥技術與裝備教育部重點實驗室、綠色化學制藥國家地方聯合工程實驗室、綠色製藥浙江省工程實驗室、浙江省新藥創制科技服務平臺、浙江省製藥科技創新基地（浙江省重中之重學科）和工業催化、生物化工等2個省級重中之重學科的研究方向，建有製藥工程、生物製藥等5個校級研究所。近年來承擔的國家級及省部級科研項目100餘項，獲得國家技術發明二等獎1項，中國石油和化學工業協會科技進步一等獎2項，省部級科技進步獎13項，發表學術論文600餘篇，其中被SCI、EI摘錄的論文400餘篇，出版專著3部，已授權發明專利110項。
藥學院以“天人合一，循理精煉”爲院訓，堅持特色辦學，勇於開拓創新，爲建設成爲國內知名的高水平教學研究型學院而不懈努力。