1、選購質量好的移動硬盤
大家不要貪圖便宜而選購過於廉價的移動硬盤，因爲價格便宜的移動硬盤，是使用價格低廉的用料製作而成的，這樣的移動硬盤不僅運行不穩定，而且還容易帶來安全呢隱患。所以，建議用戶應該徐昂夠質量好，做工優秀的移動硬盤。
2、移動硬盤分區不要超過2個
如果移動硬盤分區超過2個，啓動移動硬盤時將會增加系統檢索和使用等待的時間。使用Full Speed USB2.0(以前稱USB1.1)傳輸接口的用戶，移動硬盤的分區更不應該超過兩個，否則將浪費掉許多寶貴的時間。
3、不要長期將移動硬盤插在電腦上
移動硬盤是用來臨時交換或存儲數據的，而不是一個本地硬盤。相比於內置硬盤會時刻都工作在惡劣的環境下，應該儘量縮短工作時間。如果有需要轉存下載資料的，正確的使用方法是使用本地硬盤下載和整理資料等，然後再將數據轉移到移動硬盤上,而不要在移動硬盤上完成。做工較好的移動硬盤盒也應該儘量按此操作，畢竟這樣可以更穩妥一些。
4、不要頻繁對移動硬盤整理磁盤碎片
對移動硬盤進行磁盤碎片整理會很容易損傷硬盤。如果確實需要整理，方法可採用將整個分區裏面的數據 都copy出來，再copy回去。
5、不要使用USB延長線
由於USB延長線的質量一般不太好，這會使USB數據同步出錯，使移動硬盤不能正常工作。如果機箱上的前置USB接口無法保證正常使用，多半爲供電問題，則應儘量把移動硬盤插在原主板背板的USB接口上。
6、使用輔助供電線
移動硬盤盒最好自身帶有輔助供電線，好的移動硬盤盒會提供變壓器，一般的移動硬盤盒也有單獨的`PS2或者USB 供電線，供電不足時一定要插上，即使USB接口供電足夠帶動硬盤，如果不是短時間工作，建議也插上，USB接口的供電總是比較勉強。
7、不要混用供電線
由於移動硬盤盒的供電線存在專用現象，供電線接口電壓可能會有所不同，亂插輕則燒盒子，嚴重則會燒燬硬盤。
8、細碎的文件，應打包進行轉移
複製移動大的文件肯定比細碎的小文件有效率，太過細碎的小文件建議可以打包後(壓縮方式採用“存儲”即可) 再進行復制移動。
9、要妥善保護移動硬盤
切忌摔打，輕拿輕放;注意溫度，不要過熱;乾燥防水，先退後拔。