會計覈算工作作爲事業單位財務管理活動的重要組成部分，對事業單位的改革和發展有着重要影響。隨着市場經濟的不斷髮展，事業單位的會計覈算工作面臨着新的問題、新的挑戰。因此，有必要對當前事業單位會計覈算展開探索，探索解決會計覈算中存在問題的一些對策，這對提升事業單位會計覈算質量，保證事業單位健康穩定的發展具有重要的意義。
一、事業單位會計覈算中存在的問題
(一)會計覈算基礎存在侷限性
目前事業單位會計覈算基礎主要採用的是收付實現制，它是以款項的實際收付爲標準來處理經濟業務，如某些收費項目提供的是跨年服務，在收付實現制下當款項實際收到時全部確認爲當期收入;某些支出如印刷費支出。在收付實現制下當款項實際支付時全部確認爲當期支出，那些當期已發生但尚未支付的費用得不到反映，使得會計覈算不完整，會計信息缺乏可比性。
(二)會計基礎工作不規範
在會計覈算中往往忽視對基礎工作的管理，填寫會計憑證不規範，摘要填寫過於簡單，所附單據張數漏填、錯填;會計科目使用隨意性強，會計人員根據自己的理解和偏好使用會計科目;會計業務處理不嚴謹，有些收入款項不附業務部門的確認單;會計憑證審覈不仔細，會計科目的使用錯誤未能及時發現;未達帳項和往來款項的清理不及時，跨越時間長、資金餘額大等。由於對這些會計基礎工作的忽視，將會給日後的查閱賬簿、彙總數據、分析說明工作帶來不必要的麻煩。
(三)固定資產的核算辦法
導致會計信息失真事業單位的固定資產是以歷史成本計價的。固定資產一旦形成，其賬面價值將始終保持不變。同時事業單位固定資產只覈算其賬面原值，不計提折舊，固定資產從購置到報廢，會計賬面始終反映的是原值。其在使用過程中因磨損或技術進步等原因而減少的價值在事業單位的資產中得不到體現。這使得固定資產的賬面價值與實際價值產生差異，並隨時間的推移其差異越來越大，導致固定資產出現虛增現象，使提供的會計信息失真。
(四)不重視預算管理
事業單位的預算管理應貫穿於預算編制和執行的全過程，預算管理工作的優劣對財務管理工作質量有着直接的影響，但是許多工作人員在意識與認識上受到傳統觀念的影響，認爲預算管理僅僅是財務部門的工作，對預算既不瞭解也不關心。預算的編制不夠科學，不能結合下年度的工作安排和重點工作的需要統籌安排，所編制的預算帶有一定的隨意性。預算編制內容不夠完整，某些應該納入預算管理的項目遊離在預算之外。對預算執行的認識不夠，認爲預算不夠用可以繼續申請，預算有餘額就可以隨意花，預算超支可以寫說明，缺乏嚴肅性。
(五)財務管理制度和內控制度
不健全財務管理制度不健全，對會計人員的工作職責、會計人員工作交接手續、帳務處理程序、會計憑證的使用和保管等都沒有明確的制度規範，有的規範只停留在形式上，沒有得到有效的落實。
(六)會計人員素質參差不齊
由於長期忽視對新業務知識和業務法規的學習，致使會計人員的業務能力得不到提升。雖然會計人員每年都參加會計繼續教育培訓學習，以通過會計證的年審工作，但事實上這種爲年檢而組織的培訓學習常會流於形式。從而導致會計人員的知識層次、執業能力參差不齊。
二、解決事業單位會計覈算中存在問題的對策
(一)採取收付實現制與權責發生制相結合的會計覈算
基礎事業單位會計準則規定：事業單位會計覈算一般採用收付實現制，但經營性收支業務覈算可採用權責發生制。隨着經濟的發展，事業單位也逐步向市場經濟邁進，顯然收付實現制已經不能適應事業單位的管理制度改革的需要。這就需要事業單位採取收付實現制與權責發生制相結合的會計覈算基礎，取長補短，發揮各自的優勢，根據經濟業務的不同性質和實質重於形式原則，對經營性收支建議採用權責發生制，從而正確的反映各個會計期間所實現的收入和爲實現收入所應負擔的費用，將各期的收入和與其相關的費用相匹配，正確確定各期的利潤。對於非經營性收支仍保留收付實現制，這樣可以大大提高事業單位會計信息的質量和決策相關性，從而避免人爲原因造成的財務信息失真。
(二)強化會計基礎工作，提高會計覈算質量
首先加強對會計人員的職業道德教育，要求會計人員嚴格遵守職業道德，恪盡職守，客觀公正，實事求是，促進會計行爲規範化，提高會計職業道德水平。其次建立健全財會人員業績考覈、晉升、淘汰等獎懲制度，根據會計人員崗位不同制定不同的考覈標準，約束會計人員的工作行爲，努力提高會計覈算質量。
(三)改進固定資產會計覈算辦法
事業單位固定資產的核算，可以借鑑企業會計制度，增設“累計折舊”科目，按照企業會計準則中規定的固定資產預計可使用年限合理計提折舊，作爲固定資產原值的抵減項目，這樣可以充分體現固定資產淨值，有效解決了固定資產的虛增問題，確保事業單位固定資產信息真實。
(四)強化預算管理強化預算管理
首先要提高全體人員對預算管理的重視程度，從領導重視的'層面上提高對預算管理的重視程度，會計人員要加強預算宣傳的力度，轉變其他工作人員認爲預算管理只是財務部門的工作的觀念，將預算管理的理念滲透到每一位職工，人人有責。其次，細化預算的編制過程，在編制預算前摸清家底，對可供使用的資源進行清理和計算，將自上而下和自下而上的編制方法進行有機的結合，充分提高預算編制的準確性;事業單位應當將各項支出全部納入單位預算，建立健全支出管理制度。最後預算下達之後應嚴格按照批准的預算執行，合理確定實施預算的管理辦法，將預算管理融入到資金使用的各個過程中去，加強預算資金的全過程管理，杜絕預算管理中的隨意性，強化預算執行的嚴肅性，加快推進預算執行管理的規範化和法制化進程。
(五)加強內部控制、外部監督檢查力度
傳統的會計監督手段主要以查錯防弊爲主，現在的內部控制已將風險評估作爲主要的控制手段，主要體現在事前控制，這樣可以充分發揮會計人員的專業特長和監督職能，確保會計信息的真實、合法、完整，爲領導把好第一道關，以保證會計監督的針對性更強。